En agosto de 2012, el Consistorio recibió orden de reintegro de subvención con número de expediente 28/151/2009 por importe total de 73.946,50 euros, desglosados en 65.874,16 de principal y 8.072,34 euros de intereses de demora. El reintegro de debía a que la liquidación de la cuenta justificativa presentada por esta entidad era inferior al anticipo percibido.
Dicha deuda viene debido a que por Resolución del Servicio Regional de Empleo de la Comunidad de Madrid de fecha 7 de mayo de 2009, se concedió al Ayuntamiento de Moraleja de Enmedio una subvención de 323.997,06 euros para financiar los costes salariales y de Seguridad Social de trabajadores desempleados contratados para la ejecución del proyecto del Taller, por lo que recibió a finales de 2009 un anticipo por importe de 162.937,86 para la fase 2.
Ante el incumplimiento del reintegro en el año 2012 por parte del Ayuntamiento, con fecha 4 de febrero de 2016 recibieron acuerdo del inicio de expediente de compensación como deudores de la Comunidad de Madrid por un importe de 80.742,48 euros, desglosados en 65.367,58 euros de principal y 15.374,9 de intereses.
Ante la "difícil y grave situación económica", la Concejalía de Hacienda solicitó que en el expediente de compensación tan solo se incluyeran 26.680 euros y el resto de deudas se fraccionaran a tres años ya que por esas fechas era complicado poder abonar todo el importe reclamado por la Comunidad de Madrid, que finalmente autorizó el fraccionamiento en tres años.